与EBV相关的胃癌（EBVaGC）的特征在于高频率的DNA甲基化。在这项研究中，我们通过分析NIH TCGA（癌症基因组图谱）的转录组学和表观基因组数据，研究了宿主基因组的表观遗传学改变如何促进EBVaGC的发病。我们确定免疫相关基因（IRGs）是一组宿主基因，通过DNA高度甲基化在EBV阳性胃癌中优先沉默。选定的IRGs的进一步功能表征表明，它们不仅具有针对EBV的抗病毒活性，还具有针对KSHV的抗病毒活性。特别是，我们显示金属硫蛋白-1（MT1）和同源盒A（HOXA）基因簇通过EBV驱动的DNA超甲基化被下调。几种MT1亚型可抑制EBV裂解复制和后代病毒粒子的释放以及KSHV裂解再激活，表明这些基因的功能冗余。
    此外，单一的HOXA10亚型对EBV和KSHV均具有抗病毒活性。我们还证实了在EBV和KSHV裂解性重新激活的情况下，其他失调的IRGs（例如IRAK2和MAL）的抗病毒作用。总的来说，我们的结果表明，IRG的表观遗传沉默是一种逃避免疫监视并促进病毒繁殖的病毒策略，考虑到这些IRGs具有针对这些分子的抗病毒活性，IRG总体上有利于人类γ疱疹病毒（EBV和KSHV）的病毒致癌作用。
 
Fiches GN, Zhou D, Kong W, et al. Profiling of immune related genes silenced in EBV-positive gastric carcinoma identified novel restriction factors of human gammaherpesviruses. PLoS Pathog. 2020;16(8): e1008778. DOI: 10.1371/journal.ppat.1008778