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MicroRNA hsa-mir-3923可作为胃癌的诊断和预后生物标志物

2020-10-20 科研新知

   胃癌(GC)是指常见的消化系统疾病,其发病率很高。MicroRNA hsa-mir-3923属于一种miRNA,其功能仅在乳腺癌,胰腺癌和胃癌的癌前阶段进行了研究。尚未在胃癌中进行研究或报道,因此研究了胃hsa-mir-3923的表达与GC病例的临床特征和病理之间的关系。本研究采用数据挖掘来分析《癌症基因组图集》数据库中的胃癌数据。进行卡方检验,以评估hsa-mir-3923表达与临床相关变量和病理调节变量之间的关系。
   这项研究使用Kaplan-Meier曲线评估了hsa-mir-3923在预后过程中的作用,接收器工作特性(ROC)分析和比例危害模型(Cox)研究。通过使用基因表达综合总线,这项研究进行了基因集富集分析(GSEA)。同时,比较了常见的miRNA数据库以预测潜在的靶基因。正如共表达分析所揭示的那样,可能存在一个包含hsa-mir-3923的监管网络。为了分析GC中最紧密相关的细胞学行为和途径,
    本研究采用了注释,可视化和集成发现(DAVID)和基于KO的注释系统(KOBAS)的数据库。使用Cytoscape,R和STRING来映射显示与hsa-mir-3923相关的可能的调控网络。最后,我们获得了与hsa-mir-3923最紧密相关的69个基因,并描述了它们与Circos图的关系。结果显示,hsa-mir-3923在胃癌中表达上调,表达时与生命状态,N期和组织学分级有关。miRNA靶基因的预测结果表明,胃癌中66个基因与hsa-mir-3923之间可能存在密切关系。如共表达数据所示,可能存在一个由4个基因组成的小的调节网络。我们的结果表明,hsa-mir-3923的高表达表明GC患者的预后较差。
    miRNA靶基因的预测结果表明,胃癌中66个基因与hsa-mir-3923之间可能存在密切关系。如共表达数据所示,可能存在一个由4个基因组成的小的调节网络。我们的结果表明,hsa-mir-3923的高表达表明GC患者的预后较差。miRNA靶基因的预测结果表明,胃癌中66个基因与hsa-mir-3923之间可能存在密切关系。如共表达数据所示,可能存在一个由4个基因组成的小的调节网络。我们的结果表明,hsa-mir-3923的高表达表明GC患者的预后较差。
 
Yang X, Zhang Z, Zhang L, Zhou L. MicroRNA hsa-mir-3923 serves as a diagnostic and prognostic biomarker for gastric carcinoma. Sci Rep. 2020;10(1):4672.. doi:10.1038/s41598-020-61633-8
 

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