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胃癌遗传易感性的16p13基因变异对lncRNA的远程调控

2020-09-08 临床进展
 
    易感基因座在胃癌发生中的生物学效应鲜有报道。我们在18852名个体中进行了一项大规模的跨系遗传研究,确定了16p13的潜在因果变异rs3850997 T>G与胃癌风险降低显著相关[比值比(OR)=0.87,95%可信区间(CI)=0.83-0.91,P= 2.13 × 10-9]。这种风险效应是通过定位的长非编码RNA GCLET介导的(胃癌低表达转录本;OR=0.987,95%CI=0.975-0.999,P=0.018)。从机制上看,rs3850997通过影响CTCF的结合亲和力,对GCLET发挥了等位基因特异性的远程调节作用。此外,GCLET通过与miR-27a-3p竞争来增加表达,并且这种调节显著影响体外、体内和临床胃癌表型。这项发现突出了癌症的遗传功能及其对病因和病理的影响。

Du M, Zheng R, Ma G, et al. Remote modulation of lncRNA GCLET by risk variant at 16p13 underlying genetic susceptibility to gastric cancer. Sci Adv. 2020;6(21): eaay5525. Published 2020 May 20. DOI: 10.1126/sciadv.aay5525

 

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